Хронический эндометрит рассматривают как аутоиммунный процесс, для которого характерна инфильтрация эндометрия NK-клетками, B-лимфоцитами и группой антигенов гистосовместимости HLA-DP, DQ, DR, а также нарушение экспрессии рецепторов стромальных и эпителиальных клеток к половым стероидам в эндометрии. При контакте с антигенами происходит активация лимфоцитов, которые формируют воспалительный процесс в ткани эндометрия, а затем аутоантигены продолжают поддерживать активацию лимфоцитов. Определение ряда иммунокомпетентных клеток позволяет достоверно выявить наличие хронического воспаления в эндометрии, оценить степень его выраженности, а также выявить аутоиммунный характер воспаления.